牛奶作為液體形態的優質蛋白質食物，屬於含有能量的液態食物最優質的一種。
所以請留意，這裏我強調了兩個分析點：
1.液體且含有優質蛋白質
2.含有能量的液體
液態食物且含有優質蛋白質是很稀有的類別
首先，你怎麽定義「營養含量不高」，如果你定義牛奶不高的話，那你認為什麽叫做高？
而且即使比起來，牛奶也比你列出的麪包，巧克力好很多，關鍵在於你不能純粹比較數碼，有的數碼比較小反而更營養。比如醣類，能量以及飽和脂肪。
一般食品中定義營養高不高是要看它每100ml含有的能量和各種正面營養（蛋白質，維生素，礦物質）和負面營養（飽和脂肪，鈉）所占的比例，如果一個食物能量密度和負面營養物密度都比較低但是正面營養密度高而且好吸收的話，那麽絕對屬於營養含量高的食物，低脂脫脂牛奶是經典的高營養食物。
牛奶是種接近「全營養」的食物
牛奶其實是小牛的食物，因此對小牛是種全營養物質。但是對人並不是，只是它也已經非常接近。所謂「全營養」的意思就是指「單純用一種食物也能基本滿足所有營養需求」。因此基本也只有供給哺乳動物幼崽的乳汁才是「全營養」物質。
牛奶當中的蛋白質很優秀
在宏量營養素中，牛奶最重要的幾項營養指標是：蛋白質。中國的牛奶蛋白質需要在3.0g/100ml以上，優質的牛奶可以達到3.6g/100ml。牛奶的蛋白「生物價」（判斷蛋白質被人體利用的程度的指標）非常高，僅次於全蛋。屬於不折不扣的優質蛋白。所以不少亞洲國家用來「強壯兒童體魄」的工程，就是讓每個孩子每天喝一袋奶，這是非常有道理的。
這是中國一個牌子全脂奶的營養標
這是一個國外牌子的全脂牛奶營養標簽，非常合理的顯示了幾項必要而且重要的營養成分。
更加好的例子是上面這個圖片，還顯示出250毫升 脫脂 牛奶對人體每天所需推薦量營養的貢獻比例（性價比），你可以看出 脫脂牛奶 是很好的東西——每4%的能量就能滿足你41%的鈣，18%的蛋白質--而且牛奶裏的蛋白是優質蛋白，含有人體所需的 全部8種胺基酸（嬰兒9中） ， 6種半必須胺基酸 。
牛奶含有飽和脂肪，可以透過選擇脫脂奶進一步最佳化「營養密度」
而脂肪只有僅僅0.4%，飽和的也才0.8%，鈉也很低5%。就說明脫脂奶在帶給你最大好處的同時，把脂肪的負面作用還消除了。（很多同學也會說，綠葉菜也有很多鈣等等，但是牛奶裏的鈣是非常好吸收的，考慮到吸收率，牛奶性價比依然超高）。
這裏還需要給大家科普一下的是，要不要選擇脫脂/低脂的牛奶，還需要考慮自己整體膳食的熱量攝入。對於熱量攝入不夠胃口不佳的人群，選擇全脂牛奶是非常合適的。因為牛奶脂肪並不算太高，但是同時還能帶來一部份脂溶性維生素，最重要的是全脂牛奶口感是脫脂奶無法比擬的。
詳細可以看下面這篇回答：
牛奶最大營養優勢，是吸收率
是因為牛奶裏有很優質的蛋白質和鈣，吸收率非常高，並且牛奶如果脫脂或者低脂飲用的話，熱量並不高（全脂奶平均270kj/100ml 脫脂奶150kj/100ml）。
按照平均推薦飲用量250ml的話，就是全脂675kj每天，這僅僅占一個不減肥輕體力的成年女性每天能量攝入量的10%，和同樣男性的8%。
牛奶中的鈣，是遊離鈣和酪蛋白鰲合鈣
250毫升的牛奶裏，你能喝到300毫克以上的鈣（看牛奶質素），這幾乎占了每日推薦量的40%以上，還有8.8克的好吸收蛋白質，這占了將近一天所需的18%的蛋白質攝入量。不考慮少量確保貴的維生素D（因為你並沒更好的其他食源途徑攝入維D），你還覺得牛奶營「性價比」不高麽?
牛奶的負面評價分析
不過，牛奶最近爭議很大，因為它主要的蛋白質--酪蛋白會對人體產生一定的負面作用，並且牛奶裏含有天然的牛產生的IGF-1(胰島素樣生長因子）對人體或有不利影響。但是在適度飲奶的範圍內，牛奶肯定是對人體有很大好處的，尤其是低脂，脫脂奶，以及酸奶。
補充一點關於題主說牛奶當主食：牛奶是不可以當作成人的主食的。至於幼兒也是不可以，嬰兒最好的主食只有母乳，牛奶是一定不可以直接代替母乳的，因為蛋白質含量和乳糖含量都差別很大。嬰兒喝的都是模仿母乳做的嬰兒配方奶粉，跟普通奶粉不一樣。
而且牛奶很可能會對四個月以內的嬰兒造成終身的過敏反應，因為嬰兒腸道發育不全，牛奶蛋白很容易穿過腸壁進入血液，造成身體永久性免疫反應--終身牛奶過敏。牛奶過敏不是乳糖不耐，在國外相當常見。
即使近來出現了The China Study（中文名【救命飲食】）這樣爆炸性對牛奶有負面評價的研究。可是你只要保持適量（大概就是保證每天總蛋白供能比15%以內，減肥的人可能做不到），而你每天一杯250ml牛奶（最好低脂，脫脂），或者一杯200g的酸奶離蛋白質過剩還差太遠啦。
因此，每天喝適量的乳制品，對大多數人都是利大於弊的；尤其對於兒童少年的獲益很大。
