最近才發過一篇Angew的過來強答一下。總得感覺就是作為一個腿部掛件,導師對整個工作的影響遠大於我個人努力。
本科畢業之前,我就聽說過JACS和Angew. Chem.,也聽說過在上面發過論文的各位傳說中的前輩。我碩士課題就是碩士導師根據一篇Angew. Chem.給我定的課題,可惜我水平有限,而且那個領域確實缺乏新意,我最終只做出兩篇水文了事。那時對我來說,Angew. Chem.是遙遠可望而不可即的。
加入TC group的第二年,帶我的以色列博後就跟導師合作發了一篇Angew. Chem.,那篇論文可謂是我讀到的第一篇驚艷的論文。那篇文章的創新點是很明確的,拓寬了順反異構化的思路。整篇論文的構思是透過得到電子和失去電子,越過能壘。重點是他們選了一個適當的體系,做了很有趣的結果。雖然使用的方法很耗時,但是因為選的是個小分子,所以給人一種「我上我也行」的感覺。
你說我不羨慕,那是假的,畢竟在這種雜誌上發論文,是每個化學專業的學生的追求。但是那時候我覺得我沒有那麽聰明,而且課題也不是熱點,很難出成果。
答辯以後,導師跟我討論,他給我了個新課題,就是把Li放到C20環裏(這成了Li@Cn的第一個體系)。用他的原話說,就是他覺得沒人想到過這個體系(其實90年代就有類似的研究了,最近還有篇PCCP討論了類似體系,不過確實沒有Li的體系)。實話說,我不喜歡這個體系,不僅是因為我花了兩年時間研究這個體系才出了一篇JCP,更重要的是最後的結論是基於非常小的能量變化,導致結論可信度堪憂。我認為這種水平下我們的方法需要改進,方法的開發者Prof. Stanton也是這個意見,但是導師的意思是我們先做到現有條件的最好結果。最後我決定試試看。
事實證明Li和環相互作用很復雜,可以形成多種束縛態。如圖所示:
導師很喜歡這個這張圖,他覺得這圖就像從一個被掐住脖子的人變成一個類似土星環的東西(我想到的卻是十八世紀時流行的女士束腰這種擠壓內臟的東西,你看左上角那個圖就像被擠出來的)。
導師跟我說,他最開心的一點是我的EA-EOM-CCSD頻率計算證明DFT的結構最佳化又錯了(我後來上論壇上看了,即便用DFT發了很多篇碳環研究的大佬,也知道DFT的結構最佳化是不可靠的),這樣他又可以痛批DFT了。我心想,那是因為你有我這個願意拿這種方法算Li@C20體系的振動頻率的工具啊,一個頻率計算少則一個星期多則一兩個月,除了我真沒人幹這苦差事。我為了數據準確性還總是加班,為了修正一個因為程式BUG造成的錯誤數據,用了一個周末把Li@C12體系的振動頻率重新算了一遍,不然你哪來痛批DFT的論據啊。
導師因為對這個課題特別感興趣,所以有很多腦洞大開的想法,為了驗證這些想法,我足足加班了兩個月。最早我們只是想研究Li@C20環而已,結果把Li@C4m這個系列研究了一遍,不僅如此,還最佳化了對應的陽離子態和碳環本身的結構,這些結構最佳化都是基於CCSD和EA-EOM-CCSD方法(做過結構最佳化的都知道這是什麽概念),極為耗時。舉個例子,審稿人有一個問題是:為什麽你的數據裏Li@Cn有Li@C12到Li@C24的結構,但是碳環只有C12到C20碳環的結構,卻沒有C24的結構呢?我承認,看到這個問題的時候我笑了很久,當然是因為碳環最佳化是導師臨時要求加的,結果C24環的內容算了一個月,到投稿了還沒算完。好在後來我還是把這個最佳化給算完了,不至於要我重新計算。
當然,有時候我沒註意,也會被導師坑。這篇論文裏有兩個能量較高無關緊要的束縛態(圖中的c和d代表他們的HOMO),不知道導師在寫論文時是怎麽想的,加了一句話說這兩個束縛態能量高是因為他們HOMO的電子雲彌散程度比較高。我看得一楞一楞的,因為我們根本沒有分析過束縛態啊,你怎麽空口白話得出這種結論的?後來想想導師可能有他的道理,我就沒纏結這句話了。然後審稿人一下就找到了這個點,表示:為什麽我從圖上看不出來啊?於是,我專門對這兩個態做了分析,結論是:何止看不出來,壓根就沒有彌散,跟a和b沒有區別,所謂彌散的整句話就是導師胡謅出來的。好在,導師也回過味來,老老實實地把這句話去掉了,還問我們為什麽要寫這句話?這時候我只能做個悲傷的表情,表示我真後悔沒勸導師把這句話去掉。
當然了,導師大部份時間還是靠譜的,關鍵時刻還能點醒我。比如審稿人問過一個EE態解離能的問題,因為我們在論文裏號稱某個束縛態是範德華力束縛的(不用猜也知道是導師寫的)。我開始算出來解離能是0.2 eV這個水平,比範德華力的數據大了一個數量級。導師點了我一句,說basis set superposition,我一聽就明白了,說的是BSSE校正問題。我一直處理的都是強相關體系,所以沒想起來這是弱相互作用體系,需要考慮這個校正,加了校正以後數據就令人滿意了。
論文接收以後,導師很高興(任何論文發表他都很高興,何況是這種高水平論文),還管我叫Mr. Angewandte。我心想您別逗我了,我要是叫Mr. Angewandte,您這種不算這篇,發了5篇Angew, Chem.,9篇JACS,和33篇PRL的大牛人,又該叫什麽?導師還跟我說,他很高興我有這篇文章,因為我們專業不跟實驗組合作發這雜誌可太難了,這篇工作不錯,對我以後有幫助。我很感動,畢竟我一直以為他不是很在意我的論文發表情況的,而我很清楚一篇論文發的好不好,學生只能決定下限,導師的選題眼光和投入的心血以及本身的名聲才能決定工作上限。我很清楚這次導師的名氣給我帶來了很大的幫助,所以我才說我是個腿部掛件。我很清楚我是個腿部掛件的事實,因為同時期我的另一篇論文,從頭到尾幾乎都是我自己的構思,導師只是改了改稿子,結果被Carbon和Nanoscale兩連拒直接掉到PCCP去了,看來我還是需要學習一個啊。
現在的感想呢,就是希望我的結論是經得起時間檢驗的,而不是像這篇JACS一樣,搞出大新聞,讓導師蒙羞(應該不會吧,畢竟有導師把關)。
Zn真的有Zn(III)價的氧化態嗎?--JACS刊登反駁文章 - 量子化學 - 文章故事 - 小木蟲論壇-學術科研互動平台