牛奶作为液体形态的优质蛋白质食物，属于含有能量的液态食物最优质的一种。
所以请留意，这里我强调了两个分析点：
1.液体且含有优质蛋白质
2.含有能量的液体
液态食物且含有优质蛋白质是很稀有的类型
首先，你怎么定义「营养含量不高」，如果你定义牛奶不高的话，那你认为什么叫做高？
而且即使比起来，牛奶也比你列出的面包，巧克力好很多，关键在于你不能纯粹比较数字，有的数字比较小反而更营养。比如糖类，能量以及饱和脂肪。
一般食品中定义营养高不高是要看它每100ml含有的能量和各种正面营养（蛋白质，维生素，矿物质）和负面营养（饱和脂肪，钠）所占的比例，如果一个食物能量密度和负面营养物密度都比较低但是正面营养密度高而且好吸收的话，那么绝对属于营养含量高的食物，低脂脱脂牛奶是经典的高营养食物。
牛奶是种接近「全营养」的食物
牛奶其实是小牛的食物，因此对小牛是种全营养物质。但是对人并不是，只是它也已经非常接近。所谓「全营养」的意思就是指「单纯用一种食物也能基本满足所有营养需求」。因此基本也只有供给哺乳动物幼崽的乳汁才是「全营养」物质。
牛奶当中的蛋白质很优秀
在宏量营养素中，牛奶最重要的几项营养指标是：蛋白质。我国的牛奶蛋白质需要在3.0g/100ml以上，优质的牛奶可以达到3.6g/100ml。牛奶的蛋白「生物价」（判断蛋白质被人体利用的程度的指标）非常高，仅次于全蛋。属于不折不扣的优质蛋白。所以不少亚洲国家用来「强壮儿童体魄」的工程，就是让每个孩子每天喝一袋奶，这是非常有道理的。
这是中国一个牌子全脂奶的营养标
这是一个国外牌子的全脂牛奶营养标签，非常合理的显示了几项必要而且重要的营养成分。
更加好的例子是上面这个图片，还显示出250毫升 脱脂 牛奶对人体每天所需推荐量营养的贡献比例（性价比），你可以看出 脱脂牛奶 是很好的东西——每4%的能量就能满足你41%的钙，18%的蛋白质--而且牛奶里的蛋白是优质蛋白，含有人体所需的 全部8种氨基酸（婴儿9中） ， 6种半必须氨基酸 。
牛奶含有饱和脂肪，可以通过选择脱脂奶进一步优化「营养密度」
而脂肪只有仅仅0.4%，饱和的也才0.8%，钠也很低5%。就说明脱脂奶在带给你最大好处的同时，把脂肪的负面作用还消除了。（很多同学也会说，绿叶菜也有很多钙等等，但是牛奶里的钙是非常好吸收的，考虑到吸收率，牛奶性价比依然超高）。
这里还需要给大家科普一下的是，要不要选择脱脂/低脂的牛奶，还需要考虑自己整体膳食的热量摄入。对于热量摄入不够胃口不佳的人群，选择全脂牛奶是非常合适的。因为牛奶脂肪并不算太高，但是同时还能带来一部分脂溶性维生素，最重要的是全脂牛奶口感是脱脂奶无法比拟的。
详细可以看下面这篇回答：
牛奶最大营养优势，是吸收率
是因为牛奶里有很优质的蛋白质和钙，吸收率非常高，并且牛奶如果脱脂或者低脂饮用的话，热量并不高（全脂奶平均270kj/100ml 脱脂奶150kj/100ml）。
按照平均推荐饮用量250ml的话，就是全脂675kj每天，这仅仅占一个不减肥轻体力的成年女性每天能量摄入量的10%，和同样男性的8%。
牛奶中的钙，是游离钙和酪蛋白鳌合钙
250毫升的牛奶里，你能喝到300毫克以上的钙（看牛奶质量），这几乎占了每日推荐量的40%以上，还有8.8克的好吸收蛋白质，这占了将近一天所需的18%的蛋白质摄入量。不考虑少量确保贵的维生素D（因为你并没更好的其他食源途径摄入维D），你还觉得牛奶营「性价比」不高么?
牛奶的负面评价分析
不过，牛奶最近争议很大，因为它主要的蛋白质--酪蛋白会对人体产生一定的负面作用，并且牛奶里含有天然的牛产生的IGF-1(胰岛素样生长因子）对人体或有不利影响。但是在适度饮奶的范围内，牛奶肯定是对人体有很大好处的，尤其是低脂，脱脂奶，以及酸奶。
补充一点关于题主说牛奶当主食：牛奶是不可以当作成人的主食的。至于幼儿也是不可以，婴儿最好的主食只有母乳，牛奶是一定不可以直接代替母乳的，因为蛋白质含量和乳糖含量都差别很大。婴儿喝的都是模仿母乳做的婴儿配方奶粉，跟普通奶粉不一样。
而且牛奶很可能会对四个月以内的婴儿造成终身的过敏反应，因为婴儿肠道发育不全，牛奶蛋白很容易穿过肠壁进入血液，造成身体永久性免疫反应--终身牛奶过敏。牛奶过敏不是乳糖不耐，在国外相当常见。
即使近来出现了The China Study（中文名【救命饮食】）这样爆炸性对牛奶有负面评价的研究。可是你只要保持适量（大概就是保证每天总蛋白供能比15%以内，减肥的人可能做不到），而你每天一杯250ml牛奶（最好低脂，脱脂），或者一杯200g的酸奶离蛋白质过剩还差太远啦。
因此，每天喝适量的乳制品，对大多数人都是利大于弊的；尤其对于儿童少年的获益很大。
