时钟的作用是同步信号。
既然你理解存储器和加法器的功能，那么我就拿这俩来举例。完成一次加法运算，我们需要从存储器里读取两个加数，然后加法器对这两个加数进行加法运算，最后从加法器读取结果。但是电路是由延时的，加法器从读取输入到输出结果之间需要花费一定的时间，如果读取得太早就可能会得到错误的结果，那么输出端该在什么时候去读取加法器的输出？
同步电路的解决方案就是引入时钟，通过设置时钟周期来解决电路延时。如果加法器的最大延时为1ns，我们引入一个0.5Ghz的时钟，那么加法器肯定可以在一个时钟周期内完成运算并输出正确的结果。这样在运算时我们只要在输入数据后等一个时钟周期后再读取结果，就可以保证结果是可靠得了。
时钟的作用就是同步整个电路，只要对每个模块都设定好间隔多少个时钟周期后读取输出，用最小的代价确保能在正确的时刻读取。
对于CPU，最简单的CPU需要包括寄存器、ALU（逻辑运算单元）、总线、时钟和FSM（有限状态机）这些部分。具体到每一个部分除了FSM之外其实都不算难，只要有一定的基础就能完成，但是把它们组合在一起就非常有难度了。我建议还是从基础开始，先学习数字电路基础，有了充分的理解之后再去尝试CPU这种大型电路。
教材的话有很多，比如这个 数字逻辑基础与Verilog设计 (豆瓣)
