内骨骼生物并非由外骨骼生物进化而来，而是共同由古腔肠生物进化而来。
当然，说内骨骼生物演化程度更高完全没毛病，就消化、呼吸、循环、泌尿、生殖、运动、神经、内分泌八大系统的完善程度而言，内骨骼生物具有压倒性优势，这和哪个物种绝对数量更多、哪个物种延续更久都没有关系。
原因是 两种生命形式的生存策略不同 。
外骨骼更适合体形较小的个体，外骨骼既是支撑也是防护。同时较小的体形使得维持体温变得很不经济，代谢率低，所以循环系统、呼吸系统也不需要太发达。而神经系统能耗太大，所以一般也更倾向于能省则省。经济适用型躯体最大的好处是可以放开了生，反正结构简单，短时间就可以由一颗受精卵成长为成熟个体，所以，这种生存策略很成功。
内骨骼可以支撑较大的躯体——全身铠甲终归是太重了，庞大的体形下难免步履蹒跚，做不到小甲虫那么灵活。拿该楼作比喻把，小房子适合砖混结构，完全靠墙壁制成。高层建筑就得框架结构靠谱了。内骨骼，就是建筑的框架。较大的体形带来的优势很明显，可以容纳更复杂的器官，可以更好的保持体温等等……于是，内骨骼提供了很好的高度演化的空间，也非常成功。
当然，内骨骼生物也不是死板的家伙，重要的器官比如大脑、心肺，还是塞进骨骼围成的体腔内。一些部位特化成接近骨骼的结构并牢牢生长于骨骼之上用于攻击，比如角、爪、牙齿、鳞片。也有索性把骨板暴露甚至包覆于体外的，比如一些恐龙以及龟鳖。
总之，外骨骼经济实惠，内骨骼提供了更多的演化可能。所以前者数量上占优，繁殖和演化迅速；后者允许更高的演化复杂性，更适合极端的环境，无论深海还是极地都有分布（极地昆虫稀少，多为寄生）。
