先說結論：獨孤九劍遠強過六脈神劍。
獨孤九劍，算得上是金庸書裏最大的題海了，然後每一道題都出了破解方法，從招式上差不多算得上無窮無盡了。當然後世的太極劍法不在這個題海內。
六脈神劍，是以高強內力輔以六路劍法，從劍法上算不上多麽高明，各種應對方法也沒有，全靠自己悟，而高強內力誰都可以有。
先看看六脈神劍的表現。
【段譽身處慕容復足底，突見父親口中鮮血直噴，慕容復第二掌又將擊出，心下大急，右手食指向他急指，叫道：「你敢打我爹爹？」情急之下，內力自然而然從食指中湧出，正是「六脈神劍」中商陽劍的一招。旁人是「關心則亂」，他卻是「關心則出」，必須情急關切，內力方能出指。但聽得嗤的一聲響，慕容復一只衣袖已給無形劍切下，跟著劍氣與慕容復的掌力撞上。慕容復只感手臂一陣酸麻，大驚之下，急忙後躍。】段譽偷襲，與慕容復相距1公尺多點，六脈神劍對上慕容復的掌力只能震得慕容復手臂酸麻，而慕容復內力遠不如段譽，掌力也不是慕容復的長項。
【段譽側頭觀看蕭峰和遊坦之二人，心神略分，六脈神劍中立時出現破綻。慕容復機靈無比，左手揮出，一枝判官筆勢挾勁風，向段譽當胸射到，眼見便要穿胸而過。】六脈神劍雖然是無形劍氣，並非無法觀測。
【段譽只感呼吸急促，頭腦暈眩，大駭之下，閉著眼睛雙手亂點，嗤嗤嗤嗤響聲不絕，少商、商陽、中沖、關沖、少沖、少澤，六脈神劍齊發，那黃胡子身中六洞，但掌勢不消，啪的一響，一掌擊在段譽肩頭。其時段譽全身真氣激蕩，這一掌力道雖猛，在他渾厚的內力抗拒之下，竟傷他不得半分，反將那黃胡子彈出丈余。】六脈齊發也只是六脈神劍輪流使出，對付這樣的雜兵靠的還是自身內力硬抗。就算沒有六脈神劍，有這樣的內力黃胡子也傷不了他。
【獨孤九劍「破箭式」那一招擊打千百件暗器，千點萬點，本有先後之別，但出劍實在太快，便如同時發出一般。這路劍招須得每刺皆中，只消疏漏了一刺，敵人的暗器便射中了自己。令狐沖這一式本未練熟，但刺人緩緩移近的眼珠，畢竟遠較擊打紛飛急射的暗器為易，刺出三十劍，三十劍便刺中了三十只眼睛。】獨孤九劍，可以對付來自四面八方的千百件暗器，而六脈齊使，只是正面的六把劍而已。
很明顯了，六脈神劍，適合高手打低手；而獨孤九劍，卻可以低手打高手（以內力高低為準）。
六脈神劍，是以一陽指內力為基礎，可以把一陽指包含在內，算內建內功修煉方法。獨孤九劍沒有內功修習方法，但是金庸書裏是可以由外而內的，所以獨孤九劍還是更勝一籌。
書中的兩位主角，令狐沖吸星大法+獨孤九劍，段譽北冥神功+六脈神劍。令狐沖獨孤九劍都還沒徹底練成，就已經戰績明顯；而段譽被評價為不懂武功。可以看出獨孤九劍的厲害之處，在於給主角一套成體系的應對方法，這是六脈神劍給不了的，六脈神劍是一套下限高，上限低的武功。
