小刀最近在准备11.3下午的讲座(名称:siRNA实验操作小技巧),这不整理不知道,一整理吓一跳。那句话怎么说来着?越是看习惯了的东西,便越是习焉不察,美丑都难看出。
你别看siRNA的身材小,其中蕴含的奥秘可一点也不少。那么,我们就一起走进siRNA,深度探讨19bp微观世界里的那些事儿。
我们知道脱靶效应自2003年发表以来,一直是限制siRNA特异性的关键因素,影响其在功能基因组学和疾病治疗领域的应用。因此,如何使siRNA在保持特异性的同时减少脱靶效应,是各大厂商共同努力的目标。Dharmacon siRNA创新性的叠加3种技术——SMARTselection™技术、SMARTpool®技术、ON-TARGETplus™双链修饰技术,全方面提升siRNA的表现性能,同时保证防脱靶效率>90%。
SMARTselection™特殊设计算法
1. 种子域频率分析:调整反义链种子域序列排布,生成低频种子域siRNA,从而减少miRNA-like脱靶效应
2. SMARTselection™筛选器:针对一个基因设计多对不同的siRNA,将验证得到的效果最优的4对siRNA投放到产品中,确保siRNA的功能性和特异性
创新性SMARTpool® 技术
1. 将4对siRNA等比例mix形成pool,有效降低单对siRNA引起的脱靶效应
2. 确保高水平的靶向基因沉默效率:保证每个基因提供的4对siRNA中至少有3对有≥75%的靶基因沉默效率
ON-TARGETplus™双链修饰技术
1. 全方面减少脱靶效应:
1) 正义链第1、2碱基处进行化学修饰,有效防止正义链进入RISC,降低正义链引起的脱靶效应
2) 反义链第2碱基处进行化学修饰,提高反义链判别能力,最大程度减少反义链脱靶
2. 保证最优的靶向基因沉默效率:有效抑制miRNA-like作用,大幅提高siRNA的靶向敲低作用
3. 抑制假阳性显型出现:有些siRNA会在短期实验中引起细胞生长抑制,从而影响靶向基因沉默效率,ON-TARGETplus™修饰能够有效减少生长抑制,同时保证靶向基因沉默效果
综上,Dharmacon siRNA可提供人、小鼠、大鼠全基因组范围内的预制siRNA,搭配SMARTselection™、SMARTpool®、ON-TARGETplus™三大技术,为大家带来更好的siRNA用户体验。
优宁维好物推荐:
更多精彩,请咨询公众号「优宁维分子生物学」