這是個好問題，並非無事生非。
事實上，在進行一項制度設計的時候，這樣的問題是必須要考慮進去的。
而且在實際工作中，三人意見不統一的情況司空見慣、時有發生。
如果每一次三人都能迅速統一思想、達成共識，則要麽說明三人均有相當高的水平，這是理想情況；要麽說明有人搞一言堂，搞得其它人敢怒不敢言，這是現實情況。
中國軍隊從紅軍開始，到抗日戰爭時期的八路軍和新四軍，再到解放戰爭時期的解放軍，下到營連，上到軍師，均實行雙主官制度。
前期負責政治工作的主官稱為黨代表，後來統一稱呼，連級政治工作主官稱為指導員，營級政治工作主官稱為教導員，師團級往上，均稱為政治委員，簡稱政委。
相應的軍事主官稱為連長、營長、團長、師長、軍長等等。
參謀長是一個軍事職務，團一級才設，營連是沒有參謀長的。參謀長是一個單位的三把手，一把手是團長，二把手是政委。
嚴格來說，參謀長的直屬長官是團長，是團長司令部的總管，負責部隊的訓練、作戰等等，下設作訓科等。科長之下為參謀。
和參謀長類似的政治方面的，直接受政委指揮的職務是政治部主任。政治部下設人事科等，負責部隊的思想教育、人事任命等工作。科長之下為幹事。
政治部主任為四號，後勤部部長為五號。
其下為分管作戰、訓練等的副團長若幹，分管思想、教育等的副政委若幹。
所以司令（軍事主官）和參謀長更近，政委和主任更近。
換言之，在作戰時司令（軍事主官）犧牲了，在沒有上級任命的情況下，他的第一順位繼任人是參謀長，而非政委。司令犧牲了，參謀長要第一個站出來接著指揮部隊，而非政委。
政委沒有部隊的指揮權。所有的作戰命令都要以司令部的名義下達。作戰計劃由參謀長帶領司令部制定，司令（軍事主官）同意後簽署，以命令的形式下達。
政委不參與作戰命令的制定，但會參與命令的下達。在下達的作戰命令中，司令、政委、參謀長都要簽字。
政委對於作戰命令，有一票否決權。政委不簽字，這個作戰命令就不能下發。
所以這三個人的一般工作流程是這樣的：接到上級命令後，司令員（軍事主官）會下達某種決心和兵力部署給參謀長和政委，例如堅守、迂回、進攻等等。
參謀長負責論證這個決心和部署的軍事可行性，然後制定作戰方案。如果堅守不現實，不利於達成作戰目標，那堅守的決心就會被否定掉。
這是個決策的過程。決策過程中，可能還會召開軍事民主會議，將各營連長叫來開會，大家都談一談這個仗應該怎麽打，誰主攻、誰輔助、誰機動支援，怎麽才會減少傷亡，擴大戰果，更好地實作上級意圖。一般情況下，這種會都會開成各營連之間的捧高踩低會和主攻方向爭搶會。決策階段營連可以暢所欲言，但是一旦命令下達，各營連不管分到什麽樣的任務，都要堅決執行，不能再有任何意見。
政委會論證這個決心和部署的政治可行性，看是否違背黨的指示精神。如果上級讓進攻，但是這個作戰方案一看就是逃跑或投降的方案，那肯定不行。
換言之，司令和參謀長決定部隊能打哪、怎麽打，政委決定部隊不能打哪。
作戰計劃透過之後，下達作戰命令。這個命令只能司令員（軍事主官）來下。
一般是這樣：
司令員：xxx作戰命令：為實作上級的xxx作戰計劃，我決心以三個營的兵力，對xxx守敵實施穿插分割、逐步包圍、全部殲滅。下面我對兵力做如下部署：一營為主攻營，負責xxx方向的守敵，二營為助攻，負責xxx方向的守敵，三營為機動支援部隊。一營和二營的結合部為xxx，結合部守敵由一營負責殲滅。部隊兩天後的0:00分出發，各營連主官回去後，迅速傳達命令，做好出動準備。
（軍事主官下達作戰命令完畢後，政委要做戰前動員）
政委：同誌們，上級將此次任務交給我團，是對我團的充分信任和肯定。養兵千日、用兵一時，我們不能辜負黨的信任、人民的囑托，我們一定要堅決完成此次任務，誓死不退。因為身後就是我們的人民、我們的國家，我們的同胞姐妹，父母兄弟。當兵為打贏，等大家勝利凱旋、平安歸來的時候，我為大家慶功。同誌們有沒有信心？
（命令一旦下達，再無可更改，只有堅決完成。）
這項制度的設計，是防止部隊不落實黨的指示精神，叛變革命。也為了團結官兵，凝聚戰鬥力，為部隊註入精神力量。
這項制度始於三灣改編，即毛澤東率領的秋收起義部隊在上井岡山之前進行的一次改編，此次改編確立了支部建在連上的原則，確立了黨指揮槍的原則。這些原則使中國人民軍隊和舊軍閥、舊軍隊、國外軍隊區分開來了。
後來這個原則在紅軍中廣為推廣，成為我軍的建軍思想。
這是我軍的特色，也是我軍的優勢。
毛澤東非常重視政治工作，在上井岡山之前，就完成了軍隊的改造。他歷任政治委員，只做過很短一段時間的師長，那還是省委特派員誤傳中央命令，將毛澤東開除出黨之後的不得已而為之。
政治工作在我軍戰鬥力形成方面，起著巨大的作用，正是政治工作，讓戰士們知道，我是為誰扛槍、為什麽扛槍。我們是黨的軍隊，是人民的軍隊，不是哪一個人的軍隊，我們打土豪、分田地，不是為了搶票子、搶女人，發財抽大煙，逍遙快活的，而是為了打破舊制度、建立新制度，是為了搬走壓在中國人民頭上的三座大山的，是為了讓中國人民從此站起來的。正是政治工作，讓廣大工農團結在一起，爆發出了驚人的戰鬥力。
政治工作解放了每一個戰士的主觀能動性。
