1. 灰原哀在這個世上最在乎並且甘願為他犧牲一切的人 不是柯南而是阿笠博士。
【危命的復活——第三種選擇】中，灰原哀為了阻止工藤自曝身份而假裝要槍殺他。
然而，雖然行動是假的，小哀這種為了保護博士不惜犧牲一切的想法卻是真的。。。
理由。。或許是下面這幕吧。。。
在那個冰冷絕望的雨夜發現了她，把她「撿回」自己的家，無條件信任她，給了她第二次生命以及夢寐以求的平凡人的人生.......如慈父一般溫暖的阿笠博士啊。
2. 工藤心中難解的心結與終生的遺憾。
【名門連續慘死事件】中，推斷出真相與兇手後 柯南問了服部一句匪夷所思的話。
（那個水壺裏面裝的不是水，而是汽油。）
以前第一次看的時候 我還以為柯南問這句話是站在兇手的角度思考，推斷出身份敗露後後兇手會出於恐懼心理，用汽油自盡或與大家同歸於盡。
多年後重刷這集，經過長長的事件重演與兇手揭發，到結尾我才終於明白了這句話的真正含義。
（鋼琴奏鳴曲【月光】殺人事件，為復仇而殺人的麻生誠實在被柯南識破真相後自焚而死。）
柯南一直認為自己是逼死犯人的「兇手」，為此深深自責。所以當他開啟水壺發現又一名犯人為自己準備了同樣的下場後，立馬聯想到死去的麻生誠實。
由於自己的推理，又有人將會被逼到窮途末路，以至於付出生命的代價。
不難想象那一刻，工藤新一的內心是多麽震動與煎熬，以至於問出了這樣的問題。那個「殺人的經驗」，指的正是工藤自己用推理「殺死」麻生誠實的往事啊。
在那件事發生之前，新一追求的是「將犯人追到窮途末路的刺激」。
那件事發生之後，新一作為偵探，有了更深沈的反思和對犯人的悲憫。
這種成長和轉變，也算是不易發現但令人倍加感動的吧。
=====2016.05.16更新====
謝大家贊！覺得受寵若驚，為免感愧來多補充一些吧~
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3. 赤井秀一：鮮為人知的善意
赤井秀一前期的身份撲朔迷離，因此多次為柯南所忌憚。但其實只要細心觀察，在他初登場的【謎一樣的乘客】一集就可以看出他的真實身份絕非反派。
那集末尾，巴士急剎車撞到了劫持犯的炸彈定時器（手表），導致炸彈即將爆炸。註意下圖，炸彈爆炸前赤井秀一是在巴士前排位置。
隨後所有乘客開始緊急撤離，這個一晃而過的畫面是最後撤離的幾個人。左下角較晚撤出的是巴士司機，其後是攙扶劫持犯撤離的警員。而為所有人殿後的，是確保全車人安全下車後才從 後門 撤離的赤井秀一。 此時離爆炸大約只剩十秒了。
這是赤井秀一最讓我感動的細節。真正的FBI，不只是在與黑暗組織鬥爭中鋒芒畢露，更是在所有日常的緊急關頭，在身份不為人知的情形下，依然堅守自己的職責，保衛每一個平凡的生命。圖中巴士司機、警員和秀一都是本可以最早撤離的成年男子，是責任感讓他們不顧自身安危堅持殿後，而最後撤離順序的細節也默默顯示了職責的高低所在。
其實不難發現赤井秀一冷峻的外表下，掩藏著一顆隱忍而善意的心。在下屬卡邁爾屢屢失誤後秀一依然信任他，鼓舞他重拾信心；在安室透陰差陽錯間接導致摯友自殺後，秀一選擇隱瞞真相自願為他背鍋。（明美的死亡是秀一愧疚也最負爭議處，但我覺得行動前一天秀一對明美坦白身份，應該不會沒為明美準備後路，譬如可以讓明美被FBI保護，但可能明美念及小哀而拒絕了他。）
期待這個冷峻而善良的銀色子彈早日真正回歸，擁有一個令人滿意的結局。
4.貝爾摩德黑暗中的母性光輝
已經有答主提到滿月一集中 貝爾摩德最後為柯南蓋上外套的細節。當年看到這一幕的時候我也非常感動，然而現在重刷細想，我發現貝爾摩德的母性流露遠遠不止蓋外套這麽簡單。
當時貝爾摩德右臂中彈擦傷，又被子彈打斷了三根肋骨，到電話亭向琴酒電話求救時她已經連站起來的力氣都沒有了。當時她最明智的做法應該是把柯南丟下車，然後開車逃逸。
其實把柯南丟下車也完全不會怎樣，他自己醒來後也會回去，頂多感冒而已。而貝爾摩德僅因為擔心柯南感冒或發生其他意外，竟然喪心病狂選擇自己一路拖著血跡走去很遠的電話亭（為避免柯南醒後發現自己或琴酒過來發現柯南，這個電話亭距離一定不短。）就算冒著半路遇見FBI或巡警的風險也不顧，就連最後可以遮擋血跡的風衣都留給柯南，簡直到了為保護柯南可以付出一切的地步。
感覺貝爾摩德這個冷血殺手，每每遇到小孩總是容易心慈手軟一些。
二十年前沒有當即對朱蒂斬草除根，使朱蒂活了下來還成為FBI搜查官。
紅與黑系列中，又似不經意般消除了琴酒想對一個小孩滅口的想法。
聯想到貝爾摩德的真實年齡和曾說過的話，讓人不禁懷疑貝爾摩德或許真的曾擁有一個美滿家庭，因而也有溫情而母性的一面。因為擅長易容與說謊的貝爾摩德，在紐約事件雨中自述家人接連去世的悲慘經歷時，那種沈重的情感卻怎麽看都不像偽裝的。
這個世界真的有上帝嗎？如果真的有上帝，那麽努力奮鬥的人就不會有不幸了。至少天使就沒有對我微笑過，一次也沒有。
不知貝爾摩德究竟為什麽走上罪惡的不歸路，但從她期盼「被銀色子彈貫穿胸膛」這一點來說，她靈魂深處對自己所做的事又是極不認同的。有時候覺得貝爾摩德有種異常矛盾的無間道般的痛苦，黑暗與母性光輝在她身上交織，也不知最後究竟她會偏向何方。如果名柯結局真的有一個重要角色會為救柯南而死的話，我總覺得那個人不是赤井，不是灰原，而會是她。
這也是我能想到的對她而言最好的結局了。
