醫生和基因公司都不是神，無法全知全能。
Noonan症候群的病理生理機制還不是很明確，但是其與RAS/RAF/MEK/ERK訊息傳遞通路上的部份基因突變相關，RAS/RAF/MEK/ERK訊息傳遞通路為細胞生長的重要調控因素。大約50%的患者有 PTPN11 的突變，另外10%-13%和5-17%的患者有 SOS1 和 RAF1、RIT1 的突變。 KRAS 、 NRAS 、 BRAF 和 MAP2K1 上的突變也有被發現，但是患者數量比較少。現在別說全外顯子了，更厲害的全外顯子家系和全基因組家系，陽性率也不過50%，查不出來甚至查錯了都是「醫院、醫生、基因公司、家屬」這幾方不願意看到的，但沒辦法，現在醫學只能做到這些。盡量做，盡量做好，但要說「沒查出來/沒治好就要擔責」，那誰都無法做100%的保證。
現在醫學真沒那麽盡善盡美，治不好/查不出才是常見現象，特別是罕見病，本來基因位點就多，患病人群還少，noonan又容易和別的病混淆，所有的醫學知識不是天上掉下來的，只能一點一點研究，有搞清楚的部份也有沒搞清楚的部份。
鑒別診斷心面皮膚症候群（CFC症候群）：與Noonan症候群的表現存在很大程度的重疊。CFC症候群與NS有相似的心臟和淋巴系統表現。
Costello症候群：與Noonan症候群和心面皮膚症候群都存在相似之處。許多患者進行了分子遺傳學的檢測，沒有發現PTPN11的致病性突變。
Turner症候群：只在女性中出現，Turner症候群腎臟異常更常見，發育遲緩少見，左心缺陷更常見。
Watson症候群：以身材矮小、肺動脈瓣狹窄、不同程度的智力發育水平糊皮膚色素改變（咖啡牛奶斑）為特征。
Noonan症候群樣疾病伴或不伴JMML： CBL 的胚系突變能夠導致多變的表型，包括相對高發的神經系統異常、幼年粒單核球白血病易感和心臟缺陷、生長遲緩和隱睪的低發生率。
神經纖維瘤病1型：與NS共享一些表現，包括身材矮小、學習困難和牛奶咖啡斑。少數病人也有NS症候群病人類似的面部表現。這可能是由於NS和NF1同時出現。
