盡管月牙泉獨特而美麗，卻也面臨著逐漸減小的水位和湖泊面積的威脅。自20世紀80年代以來，人類活動和自然因素的影響導致月牙泉的水位逐漸下降。
為了保護這一寶貴的自然遺產，政府采取了一系列的保護和恢復措施。其中，最引人註目的是2011年的一項資金巨額的生態保護計劃，總額高達47.22億元，用於月牙泉的恢復。
這一龐大的工程計劃包括引入黨河的水、建設滲水工程、植樹造林等多種方式，旨在每年向月牙泉註入大量水源。這一舉措有效地保護和恢復了月牙泉，水位也得到了顯著提升，目前已經達到了5米深左右。
這一保護計劃也引發了一些爭議和質疑。有人對於為了僅有5米深的小池塘而花費巨額資金感到不解，認為這些資金可以用於其他更為迫切的民生領域。
首先，月牙泉不僅僅是一處自然景觀，更是一個地質奇觀。在千年前，這裏曾是黨河的古河道，隨著時間的推移，大部份古河道被流沙掩埋。而月牙泉地勢較低，中間地勢較低，地下潛流不斷補給，使其成為沙漠中的一片綠洲。這獨特的地理位置和生態系為當地的動植物提供了寶貴的生存空間。
其次，月牙泉不僅是一處自然景觀，還是中國歷史文化的見證者。距離莫高窟不遠，月牙泉是敦煌文化的一部份，見證了敦煌的興衰變遷。莫高窟是全球最大的佛教藝術寶庫，擁有數以百計的石窟和精美的彩塑壁畫。月牙泉也是許多文人墨客的靈感之源，留下了許多千古傳世的詩詞和故事。
最後，月牙泉作為敦煌地區的旅遊勝地，每年吸引著大量遊客，對當地經濟產生了顯著的拉動作用。旅遊業的發展不僅帶動了當地農牧民的增收，還創造了就業機會和技術創新平台。這些都為當地社會的穩定和人才培養提供了有力的支持。
對於月牙泉的保護與恢復工程，不僅是為了維護一個小池塘，更是為了保護一個自然奇觀、歷史文化寶藏以及推動當地經濟社會的發展。投資與努力不僅僅是為了眼前的平衡，更是為了實作更大範圍的生態平衡和文明繁榮。
