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基因突變不是隨機的,【自然】新研究顛覆百年理論

2022-01-14知識

自20世紀上半葉起,突變的隨機性就一直是生物演化理論的重要基礎。這個觀點如同生物學領域的公理,對於生物學家建立演化模型、理解遺傳多樣性產生了深刻影響。現在,這個經典的觀點受到一項全新研究的有力挑戰。

在一篇發表於【自然】雜誌的最新論文中,一支國際研究團隊透過對模式植物阿拉伯芥的研究提出, 突變的誕生不是完全隨機的,相反,突變出現的區域有著明顯的規律性。 這個發現從根本上改變了我們對於生命演化的理解,並且有望幫助科學家培育具有更優良性狀的作物,甚至幫助人類對抗癌癥。

「我們總是認為突變是在基因組中隨機出現的,」本文通訊作者,加州大學戴維斯分校的Grey Monroe教授表示,「但結果表明突變遠不是隨機的,而這種非隨機的方式有利於植物生長。這也為我們理解突變提供了全新的方式。」

為了尋找突變背後是否存在更深層次的規律,研究團隊對阿拉伯芥進行了深入研究。由於具備基因組較小、易於培養且繁殖迅速等優點,這種樣貌普通的「野草」已經成為套用範圍最廣的模式植物。

▲對阿拉伯芥的研究讓我們對生命演化產生了全新的認識(圖片來源:Pádraic Flood)

以往人們認為,突變在基因組不同區域出現的頻率不同,完全是隨機突變之後自然選擇的結果。在這項研究中,研究團隊在受保護的實驗室環境中種植阿拉伯芥,這樣的環境使得 一些攜帶不利突變的個體也能存活,從而避免了自然選擇的影響 ——在野外,這些突變導致的缺陷使得植株通常無法幸存。

隨後,研究團隊耗時3年,對數百株在這種環境中栽培的阿拉伯芥進行了DNA測序。結果,他們一共發現了超過100萬個突變。從如此眾多的突變中,研究團隊發現了怎樣的規律?

「我們的發現似乎與現有理論相悖,後者認為最早的突變是完全隨機的,只有自然選擇能決定哪些突變這生物體內出現。」論文另一位通訊作者,德國馬克斯·普朗克發育生物學研究所的Detlef Weigel博士表示。

相反,他們意外地發現基因組的 一些特定區域突變率明顯更低 ,尤其是對其生存起決定性作用的必需基因,例如參與細胞生長與基因表現的基因。相比於周圍其他區域, 基因體區域的突變率降低了50%以上,必需基因的突變率更是下降了三分之二。 導致這些區域突變率差異的主要原因不是自然選擇,而是表觀基因組—— 超過90%的突變率差異都與表觀基因組相關。

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釋出於 2022-01-14 09:43
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