關於這個在漫畫裏其實也有答案了：
佐助一開始是想遵循鼬的「指引」殺掉「最好的朋友」鳴人，以此來獲得和鼬抗衡的力量以便進行復仇，但是在後續和鳴人的戰鬥中，佐助的想法改變了，最後決定「靠自己的方法」來獲得力量進行復仇。
在佐助經歷了滅族慘案之後，當夜發生的一切以及鼬的話語其實就如同夢魘一樣纏繞著他，鼬在佐助的眼中確實是殺害父母屠戮親族的仇人，但是鼬留下的話也成為了佐助的指引。
可以說為了復仇，佐助已經不惜一切。尤其是在收到了宇智波鼬和音忍四人眾的蠱惑之後，佐助的復仇之火重燃，他向宇智波鼬復仇的心情也愈發迫切。
而向宇智波鼬復仇，首先便是需要能 與之抗衡的力量 ，這也是佐助明知道大蛇丸不安好心但是仍然一心前去的主要原因。
而除了大蛇丸這個「外力」之外，佐助同樣也需要 「內力」 ，這個內力便是萬花筒寫輪眼。
而從上一個萬花筒寫輪眼使用者宇智波鼬那裏得知，想要開啟萬花筒寫輪眼，就要殺掉自己最好的朋友。
因此在鳴人質問佐助第七班的夥伴情誼的時候，佐助非常無情的做出了回答：
第七班所做的事情，最大的意義便是讓佐助覺得鳴人就是他最好的朋友了。
無論發生什麽事（即便是投奔大蛇丸，即便是殺掉自己最好的朋友），我都要獲得力量。
PS： 鳴人佐助終末之谷這一段其實可以關註一下佐助回憶/講述宇智波鼬說的這個開眼條件的片段，宇智波鼬這句話堪稱 「古神的低語」
當然鳴人當然不知道這句話的意思，鳴人眼中最好的朋友是可以手拉手唱歌跳舞壓馬路的，佐助眼中最好的朋友是該被一招捅死讓自己開眼報仇的。兩人的思維完全就不在同一個水平線上。
之後兩人使用千鳥和螺旋丸的第一次交鋒也讓鳴人明白了佐助對自己的殺心，而在鳴人悲痛之時佐助一心一意想的還都是要怎麽高效搞死鳴人。
再然後就是鳴人就被佐助一擊捅穿，並且險些被佐助給掐死。
如果佐助在此刻殺死了鳴人，那麽他雖然有開啟萬花筒寫輪眼的希望，但是也會因此淪為一個被復仇所控制的傀儡，將無辜之人牽連到自己復仇的漩渦中，佐助從今往後都無法救贖。
PS： 這是宇智波鼬對佐助的計劃中最失敗的一點，他雖然設計的是弟弟殺死自己為宇智波正名的劇情，但是他並沒有考慮過佐助的感受，並且在他的計劃中還加上了佐助最好的朋友（不管這個人是不是鳴人）這個犧牲品。 鼬對佐助的好是他認為的對佐助的好。
所以說九尾這時候不光是救了鳴人的命（沒有九尾鳴人可能沒法順利躲過佐助襲向心臟的那一擊，也沒法讓虛弱的鳴人從佐助的鎖喉中逃脫），也是挽救了佐助的命運。當佐助詢問鳴人究竟是什麽東西時，鳴人回復了同樣的話：
這句話讓佐助從復仇中「清醒」了過來，實作了心態的一個轉變，所以 後面兩人的戰鬥都是從自身出發的理念的辯論 了（比如我懂你啊！你懂我個瓜皮！這種），
而在戰鬥中佐助也明白，鳴人不應該成為自己復仇的墊腳石，鳴人在他心中也是十分重要的。
但是作為復仇者，佐助必須要斬斷這種情感，佐助已經決意與過去劃開界限。
在這個時候佐助對鳴人已經沒有什麽「殺心」可言了，所以在最後即便鳴人倒地昏迷，虛弱的佐助也只是選擇了離開。
過去慘劇的陰霾依舊籠罩在佐助的心頭，
但是佐助已經做出了違背指引的決定
雖然佐助最後還是投奔了大蛇丸，雖然鳴人還是未能完成帶回佐助的承諾，但是這次戰鬥其實也讓佐助「保持了自我」，他在反抗宇智波鼬控制的路上踏出了正確的一步。
所以說在後面向宇智波鼬復仇之前，佐助其實一直都保存著自己的一份良知，
當然，這份良知，
帶惡人大蛇丸是無福享受的
