在南沙群岛的最南端，我国在曾母暗沙或琼台礁中选择进行填岛，将有效保护南沙群岛南侧海域的安全。
我国在南沙群岛最南端的领土是曾母暗沙，这个地点距离中国广东省的大陆超过2000公里，而距离马来西亚最近的海岸线仅120公里，虽位于我南海九段线内的水下暗礁，其象征意义极为重要。
自汉朝起，曾母暗沙就是我国固有的领土，历代政府均在此行使国家的主权和管辖权，这一传统延续至今。
有观点认为，尽管曾母暗沙是我国最南端的领土，但由于其礁盘全都在水下，最浅的地方距离水面还有17米，若要在此进行填岛，将面临礁盘面积小、技术难度大和巨大的工程量等挑战，考虑到周围环境，有人质疑这里是否有必要进行填岛。如果不填岛，将对曾母暗沙的主权巩固和南海九段线的维护不利，长期看来也将影响领海和领土的保护。
然而，根据我国目前的科技和工程能力，填岛于曾母暗沙已完全可行。以港珠澳大桥的人工岛超级工程为例，我们可以使用「深插钢圆筒快速建岛技术」，在曾母暗沙的礁盘上填造1平方公里的人工岛屿。当然，此项工程耗资巨大，且位置靠近马来西亚的沙捞越地区，从经济和社会效益角度考虑，是否划算还有待商榷。
与曾母暗沙相比，位于其北面不足120公里处的琼台礁，在地质条件上优于曾母暗沙许多。琼台礁是南沙群岛南部北康暗沙和南康暗沙十多个岛礁中唯一有陆地的岛礁，北距我国有人居住的华阳岛425公里，东面离马来西亚海岸线不到160公里，是我国最靠近马来西亚的陆地岛屿。这里也是我国渔民长期居住的地方，附近海域是我国的传统渔场。
在低潮时，琼台礁的陆地面积可达3000平方米，整个岛礁礁盘大约2平方公里，大部分地形为礁陆，水深在1至8米之间。如果在琼台礁进行陆地填充，可以填造出2平方公里的岛屿。琼台礁变成琼台岛后，将成为南沙群岛南侧唯一的岛屿。
在曾母暗沙和琼台礁之间做出选择时，显然在琼台礁进行填岛更为合适。尽管曾母暗沙和琼台礁都位于曾母盆地，这里是南海油气资源最丰富的区域（马来西亚已在我九段线内外钻探了许多油气井），琼台礁是我国防止外国石油勘探船非法进入的前沿阵地，因此地理位置极其重要。我们的防守底线是，不允许外国油气钻探平台在我国南沙海域新开钻井。
一旦琼台礁完成填岛，再经过几年的时间，建设成为类似美济岛、渚碧岛、永暑岛的保障基地，派遣执法机构，常驻海警船，加强对附近海域的执法巡逻，可确保我南沙群岛南边海域，包括曾母暗沙在内的安全，对我九段线内的海域和岛礁起到重大的保护作用。
总结来看，琼台礁填岛的优势主要包括：
一是工程量相对较小，填岛较为容易，可以在原有陆地基础上扩展岛屿面积，节约时间与资金。
二是附近有许多暗礁和暗沙（如北康暗沙和南康暗沙系列岛礁），为琼台礁提供了天然的屏障。同时，琼台礁还能监守这些暗沙，避免被外部势力侵扰。
三是曾母暗沙（南距120公里）提供了一定的缓冲，减少了外国的直接刺激。
四是能够守护曾母暗沙及九段线内的领海和领土。海警船以琼台礁为基地，强化巡逻力度。
五是保卫曾母盆地丰富的油气资源。曾母盆地已知的石油储量超过130亿吨，对我国至关重要。
六是建立海洋环境保护站和科研站，维护南海的海洋生态环境并进行海洋生物研究。
七是保护传统渔场，为我国南海渔民提供支持，并建立渔船的避风港，岛上还将设立渔村。
八是琼台礁位于南海重要航运线路的东侧必经之地，可以为国内外船只提供导航参考、航线指引、航行安全信息及海上救援服务。
九是作为基地的功能，既是南沙物资的中转站，也是曾母盆地大规模油气开发的后勤支持基地。
十是促进与周边国家的友好交流，推动南沙地区的经济发展。
