柯南里出现的日本执法部门大部分是警察体系里的人员。还有一些比较冷门的执法单位很少有人注意到，例如在【名侦探柯南：远海的侦探】出现的海上保安厅。
两名海上保安官与目暮警官一起登上海自的护卫舰，他们的身份显示其隶属于若狭海上保安部，现实中没有这个海上保安部，若狭海域的治安警备任务由日本海上保安厅第八管区敦贺、舞鹤海上保安部负责。
但现实中的海上保安厅确实有警备课和刑事课两个单位，隶属于警备救难部。警备课负责海上安全、反恐、侦查间谍船与可疑船只。刑事课负责对海上罪案进行调查取证、拘捕目标、打击非法捕捞、应对海上犯罪。在各管区本部以及下属执法机关同样设有警备、刑事调查部门。
日本海上保安官衔与警衔等级的对应关系，其中，海上保安厅长官衔对位的是警视总监，警察厅长官衔不属于正式警衔：
| 日本海上保安官衔 | 日本警衔 |
|---|---|
| 长官 | 警视总监 |
| 次长/海上保安监 | 警视监 |
| 一等海上保安监·（甲） | |
| 一等海上保安监·（乙） | 警视长 |
| 二等海上保安监 |
| 三等海上保安监 | 警视正 |
| 一等海上保安正 | 警视 |
| 二等海上保安正 | 警部 |
| 三等海上保安正 | 警部补 |
| 一等海上保安士 | 巡查部长 |
| 二等海上保安士 | |
| 三等海上保安士 | 巡查 |
| 日本内阁 |
|---|
| 内阁府 | 国土交通省 |
| 国家公安委员会 | 海上保安厅 |
| 警察厅 | 11个海上保安管区 |
| 负责东京治安的警视厅、各地区警察本部 |
根据日本法律的规定，海上保安官是特别司法警察职员，拥有海上警察权。海上保安官与警察一样拥有刑事调查、逮捕的权力（海保厅表示他们是「海の警察官」），可以配备枪支弹药。海上保安厅管辖日本领海。日本海保厅的人数远少于警察系统，但他们装备的火力比日本警察强。
整个海上保安厅只有1万多人，警察系统光是警视厅就有好几万。
在【名侦探柯南：地平线上的阴谋】最后搭乘海上保安厅涂装直升机出现的救援人员：
这些救援人员的臂章和身上标识显示其隶属于国土交通省海上保安厅的 特殊救难队 （SRT，Special rescue team），现实中该部成立于1970年，目前总人数超过30人，分成6个救援小队。特殊救难基地位于羽田机场，与第三管区羽田航空基地共用设施（ 这个航空基地就是今年1月撞毁飞机的那个海保厅单位 ）。
海上保安厅特殊救难队：
1948年4月27日，日本颁布了【海上保安厅法】，1948年5月1日，不法入国船舶监视本部与海上扫雷机关整合成保安局，与水路局（最早负责水路测量，后来逐步扩充）、灯台局（分管航线沿路的海岸灯塔、航标）一起合并为 海上保安厅 。海上保安厅的上级机关是运输省。
1949年6月1日，海上保安厅下属的保安局撤编，改组成保安部与警备救难部，同时，其他内部厅局全部启用「部」制称呼，警备救难部的历史由此开始。
原本由保安局负责的海上扫雷工作由警备救难部门接管，在警备救难部下设海上扫雷机关负责海上扫雷任务。
1950年2月6日，日本政府授权海上保安厅除了清除战争残余水雷、沉船和航道障碍物之外，还要负责处理海底的遗留爆炸物与陆地扫雷任务。
1950年6月1日，保安部被改组为海事检查部，同时设置新的船舶技术部与航道清理部门，原警备救难部下属的海上扫雷机关划归航道清理部门。
1952年2月，海上警备队在海上保安厅的框架内成立，同年8月，海上警备队和扫雷机关划归新成立的保安厅，这俩后面改组成海上自卫队。
1960年1月，【新日美安保条约】签订，从20世纪60年代开始，日本海上保安厅负责美军船舰、核潜艇出入驻日军港时的警备任务。
1970年10月，日本海上保安厅派遣两名执法官员前往琉球协助成立海上保安机关。1971年9月，在琉球通商产业局体系内设立了琉球海上保安厅，此时的琉球海上保安厅人数不超过60人，主要任务是海上救援与交通维护，没有执法权。海上治安警备任务仍然由琉球警察管辖。
1972年1月，日本海上保安厅水路部增派一名官员前往琉球群岛，协助琉球海上保安厅组建水文气象情报部门。2月1日，日本海上保安厅开始着手准备成立第11管区。
1972年5月15日零点，美国将琉球的管辖权移交给日本，变成了冲绳县。港口内的船只拉响汽笛，升挂起日本国旗与海上保安厅的蓝底16芒罗盘星旗帜，琉球海上保安厅改变为海上保安厅第11管区。至此，日本海上保安厅的架构基本成型。
海上保安厅负责日本领海警备巡视、反海盗、海上消防救援任务，同时作为日本海洋监视体系的成员，负责海上警备情报、地理水文情报的收集。
海上保安厅本厅下设直属的行政机关，在地区派驻11个海上保安管区，各管区下设多个海上保安部、海上保安署。各型巡视船艇由各管区的海上保安部/署指挥。
海上保安厅在各管区部署「海上保安航空基地」与「航空基地」，前者除了固定翼飞机与直升机外，还会配备巡视船艇，主要执行海上监视、执法警备任务。而航空基地只配备固定翼飞机和直升机，更侧重于海上救援行动，也有部分监视任务。航空单位与各管区的海上保安部/海上保安署互不统属。
海上保安航空基地：| 关西机场·海上保安航空基地 | 隶属于第五管区。配备固定翼飞机2架，直升机2架，巡视船艇2艘。 |
| 中部机场·海上保安航空基地 | 隶属于第四管区，配备直升机2架，巡视船艇1艘。 |
海上保安厅与日本警察一样，设置有防暴单位与战术突击单位。特殊警备基地设置在第五管区，此基地作为海上保安厅的战术单位SST驻地使用，SST的行动范围不局限于第五管区的辖区。
除了SST之外，每个管区派驻有特别警备单位（特别警備隊）作为海上防暴警察使用，每支特别警备单位分为机动小组，单个机动小组人数不超过10人。
特别警备单位作为SST的支援单位使用，SST的队员从特别警备队挑选精干的海上保安官组成，这些人从SST退下警备一线后，回到特别警备单位继续发挥作用。
单个海上保安部的规模不等，除了直属行政机关和巡视船艇外，一些比较大的海上保安部也会下设海上保安署。不同的海上保安部/海上保安署下属巡视船艇在数量、型号上有所差异。
其中，第三管区横滨海上保安部除了海上保安署之外，还增设一个海上防灾基地，海上保安厅第三管区本部/横滨海上保安部本部/海上防灾基地驻地合并使用。
