自20世纪上半叶起,突变的随机性就一直是生物演化理论的重要基础。这个观点如同生物学领域的公理,对于生物学家建立演化模型、理解遗传多样性产生了深刻影响。现在,这个经典的观点受到一项全新研究的有力挑战。
在一篇发表于【自然】杂志的最新论文中,一支国际研究团队通过对模式植物拟南芥的研究提出, 突变的诞生不是完全随机的,相反,突变出现的区域有着明显的规律性。 这个发现从根本上改变了我们对于生命演化的理解,并且有望帮助科学家培育具有更优良性状的作物,甚至帮助人类对抗癌症。
「我们总是认为突变是在基因组中随机出现的,」本文通讯作者,加州大学戴维斯分校的Grey Monroe教授表示,「但结果表明突变远不是随机的,而这种非随机的方式有利于植物生长。这也为我们理解突变提供了全新的方式。」
为了寻找突变背后是否存在更深层次的规律,研究团队对拟南芥进行了深入研究。由于具备基因组较小、易于培养且繁殖迅速等优点,这种样貌普通的「野草」已经成为应用范围最广的模式植物。
以往人们认为,突变在基因组不同区域出现的频率不同,完全是随机突变之后自然选择的结果。在这项研究中,研究团队在受保护的实验室环境中种植拟南芥,这样的环境使得 一些携带不利突变的个体也能存活,从而避免了自然选择的影响 ——在野外,这些突变导致的缺陷使得植株通常无法幸存。
随后,研究团队耗时3年,对数百株在这种环境中栽培的拟南芥进行了DNA测序。结果,他们一共发现了超过100万个突变。从如此众多的突变中,研究团队发现了怎样的规律?
「我们的发现似乎与现有理论相悖,后者认为最早的突变是完全随机的,只有自然选择能决定哪些突变这生物体内出现。」论文另一位通讯作者,德国马克斯·普朗克发育生物学研究所的Detlef Weigel博士表示。
相反,他们意外地发现基因组的 一些特定区域突变率明显更低 ,尤其是对其生存起决定性作用的必需基因,例如参与细胞生长与基因表达的基因。相比于周围其他区域, 基因体区域的突变率降低了50%以上,必需基因的突变率更是下降了三分之二。 导致这些区域突变率差异的主要原因不是自然选择,而是表观基因组—— 超过90%的突变率差异都与表观基因组相关。
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