员工的体检费分为两种情况：1.劳保性质的，如职业病防治和岗位的特殊要求等；2.福利性质。
1.劳保性质的
如因职业病防治和岗位的特殊要求等具有强制性要求的，发生的体检费属于劳动保护费，可以全额税前扣除。
2.福利性质的
福利性质的体检费，属于非货币性福利，以「职工福利费支出」进行税前扣除，与其他福利费一起受14%的比例限制。
3.体检费是否缴纳个人所得税？
（1）劳保性质的体检费，肯定是不需要缴纳个人所得税；
（2）福利性质的体检费，按照总局解释人人享有且不可量化的可以暂不征收个人所得税。因此，实务中有的地方没有征收，有的地方有征收，主要是对「不可量化」的理解与执法口径的宽严程度不一致导致。
如果是以「体检费」的名义给员工发补贴的，则需要按照「工资薪金所得」扣缴个人所得税，且应以「工资薪金支出」进行税前扣除。
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