看描述的话，题主玩得相当入戏呢。不过好像还是对游戏的玩法逻辑不是很了解。甚至是网上看人说一套打法就学一套打法，没想到不同打法其实互相不太兼容。
看描述，你应该是玩到了失落帝国觉醒的时候，国内还顺便爆发AI起义。不得不说这个发展速度确实略慢了一点点。首先，请不要指望ai能帮你忙，哪怕组成联邦，它们也是各打各的，也没有足够战斗力。然后就来看你自己怎么打的问题。
群星的战争系统，说到底，就还是要靠舰队。哪怕你是和平主义者，也需要庞大的舰队来保证自己的和平。在经营当中最重要的平衡就是考虑经济发展和军事扩张的平衡。过度军事扩张会导致经济发展减速，但一直没注意发展军事，就会变成你现在这样子。
要翻盘的话难度很高，首先，你想在战场上打赢敌人，无论如何需要做的事情就是建造更多的战舰。而建造更多战舰的前提，是你有更多合金产量。
好了，现在可以把话题兜回经济。我不知道你是从哪看的教学说贸易很重要，游戏后期靠贸易补足消费品确实很好，但方法并不是靠舰队巡逻消除海盗。并且，经济系统最重要的并不是贸易，而是「最终产品转化率」
什么是最终产品？在没有mod的环境下，群星有以下几种资源：
能量，矿石，食物，消费品，合金，凝聚力，三种科研点数，爆炸颗粒，天然气，水晶，暗物质，泽洛，纳米机器人，活性金属。
后面的那些战略资源，用处要么是开法令加buff，要么是给其他生产建筑提供维护，要么是建造船只少量需求。
前面几个资源，能量用来改造星球和交易，矿物用来发展基建。在前中期，这两个资源对于经济扩张很重要，所以要设法让这两个资源有更高月收入。
食物的作用只有维持人口。以及非常少量的其他需求，比如建造殖民船。所以，食物的月收入最好控制在+10到+50，更多就完全没有意义了。你只要随着人口增长逐步增加食物产量。但是超出的产量只能卖掉，这会产生极大的效率浪费。食物是超出越少就越好。
同样情况的还有消费品。除了在星球上通过决议发放消费品，消费品是没有卵用的东西。它也是用来维持人口以及其他产的消耗。其中消耗最多的是研究。你要做的是随着研究员增加逐步扩大消费品产出，但是，过多消费品盈余根本没有意义。
真正的最终产品之一，就是合金。合金的消耗几乎没有尽头，建造舰队需要合金，建造防御堡垒需要合金，建造巨型建筑需要合金。后期没有星球可以扩张，你会不断建造新的居住站，也需要合金。这是个无底洞需求，合金月盈余有多少都不过分。在无mod的情况下，最好的合金产地是理想城。
而最终产品之二，则是科研点数，因为有循环科技这个东西，科研点数是没有需求上限的，你永远需要更多科研。
相对的凝聚力，因为中期就应该走完了所有传统，所以就没用了。
对于题主来说，你需要再审视一下国内经济状况。任何一种资源爆上限都是严重的经济损失。如果你有好几种资源爆上限，甚至是食物和消费品爆上限。很可能你的经济配置相当糟糕。
为了打赢战争，你现在最需要的事情是把资源全都转型到生产合金。把多余的食物和消费品全都卖掉（设置按月交易）。多余的电全都拿来买合金。矿石用来建造合金厂，以及生产合金使用。
千万不要觉得经济数字都是黄字爆上限，就是经济很好。那是根本经济乱套。经济发展极差才会电量+几千几万却没有派上用场。
只有合金产量跟科研点产出是你的经济。其他的数值都是辅助。再多也没有用。
再说一遍，只有合金产量跟科研点产出是你的经济。
电矿盈余1k左右就差不多了，有大量基建需求可以更多，但是太多就毫无必要。
只有合金产量跟科研点产出是你的经济。
有了合金，你就可以建造更多舰队，有了循环科技，你的舰队就会不断变强。这样，不管是内部的ai叛乱，还是失落帝国，还是最终残局危机，都难不倒你。
题外话，题主第一次玩就铁人，还不看wiki控制住ai叛乱，确实比较有挑战精神。ai叛乱有很多很多预警事件。而且还能触发补丁事件，打个补丁就彻底解决。有所准备的话不至于落到真的爆发叛乱这一步。此外唯心主义搞灵能飞升的话真的很看脸。许愿许出个灵能跃迁引擎和灵能护盾是最好的收益，但许愿遇到几个神，直接就是被游戏坑死没商量。看着是buff实际上亏本。甚至可能好几次许愿都完全没有用。无mod环境下唯心主义灵能飞升是最弱的路线。而且不能给机器人公民权就会导致ai叛乱。也难怪题主打得那么艰苦了。
哦，还有一点忘记讲了。贸易路线产生海盗的问题，前期可以派几个护卫舰巡逻一下解决。到后期，舰队巡逻也不够的。你需要的是建造星门。在首都建造星门，在收集贸易点的中心建造星门。贸易路线会经过星门直达首都，这样就再也没有海盗问题了，贸易效率永远100%。如果你没组贸易联盟，贸易政策最好选消费者利益，用贸易补足消费品。这样你就几乎不需要建民用工厂。
