首先明確的一點是，益生菌是對健康有益的、活的細菌。 人體腸道中有100萬億多細菌，大致分為有益菌、中間菌、有害菌。人體在健康的情況下腸道菌群處於一個平衡的位置，但當你出現便秘、腹瀉開始，說明腸道有害菌的數量已經遠大於有益菌和中性菌。
有害菌在腸道占據多數的時候，會引起不同的疾病，這時候就需要透過補充益生菌，來恢復腸道菌群平衡。透過抑制有害菌增殖、促進營養物質吸收、代謝合成營養物質等途徑對宿主健康產生重大影響。 一個人的身體是否健康，很大程度上取決於自身的免疫力，而決定人體免疫力的關鍵因素是「腸道」。
益生菌對人體有害嗎？
益生菌對身體是沒有害處的。 這要從益生菌的源頭講起，在新生兒出生之前，體內是沒有微生物的，但是從降生的那一刻起，微生物就開始進入嬰兒體內，我們從出生那刻起，就開始從產道、空氣、母乳、食物等渠道獲得益生菌。所以我們體內的益生菌都是後天獲得的，對人體是無害的。
關於益生菌「騙局」的說法，其實是一些無良商家造成的。
益生菌要達到一定數量才會對身體起作用，市面上很多益生菌產品，菌含量都達不到數量，卻宣傳自己的功效非常強大，這樣很難達到益生菌該達到的效果。其次，益生菌能夠起作用，一定保證你吃下去的益生菌能活著進入腸道。一是你吃進去的是活菌，二是吃進去之後還能活著，這是考驗產品好壞的關鍵。
看益生菌產品是否有活性有以下幾點需要註意：
①是否透過冷鏈運輸 ，溫度超過40℃益生菌就會開始衰亡，溫度過高，益生菌很難活下來。
②是否有恒溫倉儲 ，冷鏈運輸要進入恒溫倉才可以，如果進入到普通倉庫，夏季氣溫高時，益生菌逐漸會雕亡。
③益生菌是否有包埋技術 ，包埋層太少會過早雕亡，包埋層太多，益生菌還沒在腸道定植就會被排出體外，所以包埋技術一定要恰到好處。
