金磊 發自 凹非寺
量子位 報道 | 公眾號 QbitAI
7分鐘
,這是來自中國的一支團隊「合力出成績」、一舉打破的
世界紀錄
:
全球首次將人類
全基因組分析
,推進分鐘級時代。
這支團隊,由三家來自中國的機構共同組建。
他們這次所做的具體任務,叫做
30X人類全基因組測序(WGS)胚系變異分析
。
(其中,「30X」是指全基因組測序的深度)
而在這個團隊之前,同等條件下完成這項任務所需的時間,卻長達近
24小時
之久。
所以咱就是說,現在的「battle」結果就是——
24小時
vs
7分鐘
,效能整個提升了200多倍!
與此同時,在相同條件下的計算成本還降低了
80%
,儲存成本也下降
30%
。
但更重要的一點是,這事可能和你我都息息相關。
因為基因預測的一個用途,就是檢測罹患多種疾病的可能性,釘選個人病變基因,以此來提前預防和治療。
(P.s.世界著名演員安吉麗娜朱莉就這麽做過。)
聽起來確實是個好事,但如果放到過去,由於既耗時又費錢,能做得起基因預測的人屈指可數。
但今時不如往日,隨著算力、AI、大數據技術的不斷發展和融合,讓基因測序這樣數據密集型套用變得越發親民。
而這一次的「7分鐘」,可以說是把基因測序這件事往
「平民時代」
更推近了一步。
△ 圖源:美國國家衛生研究院(NIH)
那麽接下來的問題便是,為什麽這支隊伍的方法,就能做到「快好省」呢?
從24小時到7分鐘,他們是怎麽辦到的?
人類全基因組測序要做的事,就是對未知基因組序列的物種進行個體的基因組測序。
但非常明顯的一個難題,就是其
數量過於龐大
。
畢竟物件可是組成人體2.5萬基因的約30億堿基對,換算成容量大小則約為
3GB
。
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全基因組測序