覺得有必要回答這個問題哈。
先拋開戰鬥機不談（放最後），對於民用主流客機基本都是掛在機翼下面的 Engine Pylons Under Wing 。比如居家旅行必備的客機如A320，A330，A340，A380和波音737，747，777，787了。大家登機時看到的發動機都是這樣掛在翅膀下面的。。
原因：
首先 ，這樣可以抵消由於升力對機翼產生向上的力矩，從而達到力矩平衡。飛機之所以能起飛是由於快速前進的機翼受到空氣對其向上的升力，而寬體機的機翼又很長（十幾米到幾十米），這就像一個巨大的杠桿，翅根表示壓力很大，懸掛的發動機無疑可以抵消掉一部份的力矩。
其次 ，我認為這樣的重量分布也可以讓飛機更加穩定。想想現代戰鬥機發動機大都是在機身內部，這樣飛機可以各種打滾機動效能更好，反過來想，客機把發動機掛在兩邊，犧牲了機動性，但增加了穩定性。
第三 ，發動機尾置的設計變的少見可能和一起緊急迫降後的原因調查有關-。1991年，Scandinavian Airlines 751航班，當時的飛機是麥道MD-81. 由於機翼結的冰脫落後被吸入發動機導致兩台發動機同時失效，飛行員不得不憑借高超的技術緊急迫降，所幸無重大傷亡。下圖是出事前的飛機。
第四 ，客機航油儲存在機翼裏，方便供油。
第五 ，發動機進氣少受機翼和機身的幹擾，從而有助達到發動機理想的效率。而且實際中發動機安裝位置會靠前一點，防止發動機進氣受到機翼前緣leading edge附近向上的氣流影響。
第六 ，機翼本身可以幫忙阻擋一部份發動機的噪音到cabin。
第七 ，發動機在機翼下方更容易維護。感謝
@王彥輝。
但是 ！！並不是所有的飛機都適合把發動機掛在雞翅下面的！
因為顯而易見，它要求飛機的機翼高度相對於短艙直徑要足夠高，才能保證發動機和地面之間有足夠的空間。以避免以下悲劇的發生。。。
再比如，國內航班最常見的波音737，因為個子比較矮，CFM給提供的發動機又太大，為了讓發動機不至於蹭到地面，於是短艙被設計如下饅頭的形狀。。
於是 ，對於很多窄體飛機，當機翼高度不夠時，就只能把發動機安裝在尾部。其實發動機安裝在機身尾部也是有好處的，可以減少地面外來物體對發動機的損害，而且當只有單發動機工作時，提供比較對稱的推力減少偏航。當發動機部件失效，比如風扇葉片斷裂，渦輪盤破裂飛出發生時不是正對著客艙，不容易傷到乘客。。
發動機放在尾部的不乏高帥富的代表商務機的典範，灣流Gulf Stream。
最後回到戰鬥機。
由於戰鬥機Fighter 發動機使用低函道比的渦扇發動機（比較瘦的渦扇發動機），大部份戰鬥機的發動機其實不能說是裝在尾部，可以理解為是安裝在機身內部的。你能看到的只是前面的進氣道和最後的尾噴管。這樣做的好處很多，減少空氣阻力，隱身，機動性好，帥氣。。。
比如Top Gun中的Tomcat F-14，發動機是夾在翅膀根部的。
F-16， F-22, F-35.。
當然沒忘也有攻擊機A-10這貨的存在，
貼一張2011年在Royal Air Force Air Tatoo航展時拍到的A-10。
以上基本回答完畢。請指正。
參考：
1. http:// airplanes-aircraft.knoji.com /engine-mount-designs-in-jet-aircraft-2/
2. http:// en.wikipedia.org/wiki/P odded_engine
3. http:// adg.stanford.edu/aa241/ propulsion/engineplacement.html
4. http:// en.wikipedia.org/wiki/S candinavian_Airlines_Flight_751
