這是人類基因組計劃留下的負面遺產之一：讓人們對非編碼區有錯誤的認識和不切實際的幻想。
「基因荒漠」的說法源自人類基因組計劃的結論「人類基因組只有約 1.5% 在編碼蛋白質」，一些學者將 98.5% 的非編碼區裏 大片沒有基因的連續區域 比喻為荒漠。其實這裏面許多區域裝著 調控基因表現的啟動子、強化子、沈默子、絕緣子，還有轉錄因子的連線點位 。
另一方面，人們往往以為生物身上的任何玩意都得對前進演化有點什麽「意義」才行，並將自己一知半解或只聽過個名字的功能 往非編碼區裏胡亂歸因 ，例如「不管病毒怎麽變異，我們體內總能產生相應的抗體，你覺得那些抗體的基因是哪來的呢」這樣的純粹錯誤。
這種「前進演化意義論」是十九世紀墳墓裏散發的流毒與人類基因組計劃起初的誇大宣傳雜交的產物。自然選擇塑造的 DNA 序列不要求「有意義」「功能強大」「有種種優點」，只要你沒在傳代過程中被任何因素打斷，什麽樣的無功能廢物都可以傳下來，「在傳代之前不會高概率致死」就可以算中性性狀了，然後你需要的就只是一點偶然。
你當然可以期待「非編碼 DNA 序列突變為有功能的序列或新的基因，發揮新的作用」，但大部份突變是無用或有害的，人對多種病原體的易感性和一些癌癥的發病與非編碼 DNA 序列的突變有關。而且，目前看來非編碼 DNA 序列突變出任何有功能序列的概率都比「隨便來了個病毒，送你個有功能序列」的概率要低。
