动物的话，河蚌最佳。河蚌以水中漂浮的有机质为主要食物，食量大而净化能力强，且河蚌会翻砂，可以帮着清理底砂累积的腐殖质。
缺点：这货的幼崽是寄生在鱼儿体表的，名叫钩介幼虫，虽然通常不那么致命，但对体弱鱼儿就很不友好（若以自然之道的优胜劣汰角度看，其实是有益的）。此外，鱼缸里如果没有足够丰富的漂浮有机质或水流性不好，河蚌这等饕餮极易饿死，所以鱼缸水可不能太过清澈。
植物的话，青苔或水葫芦最佳。这两个的净水覆盖面广且效率高，生长速度较快，对水质适应力强，打理省事。
缺点：需要足够多的中强光照，水中肥浓度不能太低，平衡没做好就要爆藻。青苔对于很多人而言不够美观，水葫芦会遮挡水下光照和水面溶氧。
其实，净水依赖硝化菌为主体的鱼缸硝化系统，是鱼缸养殖过度追求观赏性的产物，是现代的一种市场洗脑后的风潮，和传统的生态养鱼在思路上差异很大。生态养鱼追求人的观赏乐趣和自然平衡融于一体，以古法缸为典型。而依赖设备的鱼缸养殖更多的是「人定胜天」的思维，尤以造景草缸为典型，水草灯和二氧化碳设备的使用，就是强行激发只适应短暂沉水生存的水生植物、可以常年的完、全沉水的旺盛生长。
