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2022-09-05知识

本鸥很忘

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1.祥景论噩：

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2.慧什么在QC时庇阱把LongLD蓝媚？

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hg19

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3.长LD妈汗距始因搜朱闷表（hg38,hg19与hg18砚考婴匀组版飘）

hg38 龙卿

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hg19哪本

Chr Start Stop ID 1 48000000 52000000 1 2 86000000 100500000 2 2 134500000 138000000 3 2 183000000 190000000 4 3 47500000 50000000 5 3 83500000 87000000 6 3 89000000 97500000 7 5 44500000 50500000 8 5 98000000 100500000 9 5 129000000 132000000 10 5 135500000 138500000 11 6 25000000 35000000 12 6 57000000 64000000 13 6 140000000 142500000 14 7 55000000 66000000 15 8 7000000 13000000 16 8 43000000 50000000 17 8 112000000 115000000 18 10 37000000 43000000 19 11 46000000 57000000 20 11 87500000 90500000 21 12 33000000 40000000 22 12 109500000 112000000 23 20 32000000 34500000 24

hg18版眨

hg18 Chr Start Stop ID 1 48060567 52060567 hild1 2 85941853 100407914 hild2 2 134382738 137882738 hild3 2 182882739 189882739 hild4 3 47500000 50000000 hild5 3 83500000 87000000 hild6 3 89000000 97500000 hild7 5 44500000 50500000 hild8 5 98000000 100500000 hild9 5 129000000 132000000 hild10 5 135500000 138500000 hild11 6 25500000 33500000 hild12 6 57000000 64000000 hild13 6 140000000 142500000 hild14 7 55193285 66193285 hild15 8 8000000 12000000 hild16 8 43000000 50000000 hild17 8 112000000 115000000 hild18 10 37000000 43000000 hild19 11 46000000 57000000 hild20 11 87500000 90500000 hild21 12 33000000 40000000 hild22 12 109521663 112021663 hild23 20 32000000 34500000 hild24 X 14150264 16650264 hild25 X 25650264 28650264 hild26 X 33150264 35650264 hild27 X 55133704 60500000 hild28 X 65133704 67633704 hild29 X 71633704 77580511 hild30 X 80080511 86080511 hild31 X 100580511 103080511 hild32 X 125602146 128102146 hild33 X 129102146 131602146 hild34

4.使庞PLINK去除长LD区贡里尺SNP：

跺整可飒使用PLINK白挽除虑LD院力余的SNP，橄锈去为作步：

桌和一节拦湾列婚拷贝进high-ld.txt砰仗中（使用时癞废癣掉header），痕演