金磊 发自 凹非寺
量子位 报道 | 公众号 QbitAI
7分钟
,这是来自中国的一支团队「合力出成绩」、一举打破的
世界纪录
:
全球首次将人类
全基因组分析
,推进分钟级时代。
这支团队,由三家来自中国的机构共同组建。
他们这次所做的具体任务,叫做
30X人类全基因组测序(WGS)胚系变异分析
。
(其中,「30X」是指全基因组测序的深度)
而在这个团队之前,同等条件下完成这项任务所需的时间,却长达近
24小时
之久。
所以咱就是说,现在的「battle」结果就是——
24小时
vs
7分钟
,性能整个提升了200多倍!
与此同时,在相同条件下的计算成本还降低了
80%
,存储成本也下降
30%
。
但更重要的一点是,这事可能和你我都息息相关。
因为基因预测的一个用途,就是检测罹患多种疾病的可能性,锁定个人病变基因,以此来提前预防和治疗。
(P.s.世界著名演员安吉丽娜朱莉就这么做过。)
听起来确实是个好事,但如果放到过去,由于既耗时又费钱,能做得起基因预测的人屈指可数。
但今时不如往日,随着算力、AI、大数据技术的不断发展和融合,让基因测序这样数据密集型应用变得越发亲民。
而这一次的「7分钟」,可以说是把基因测序这件事往
「平民时代」
更推近了一步。
△ 图源:美国国家卫生研究院(NIH)
那么接下来的问题便是,为什么这支队伍的方法,就能做到「快好省」呢?
从24小时到7分钟,他们是怎么办到的?
人类全基因组测序要做的事,就是对未知基因组序列的物种进行个体的基因组测序。
但非常明显的一个难题,就是其
数量过于庞大
。
毕竟对象可是组成人体2.5万基因的约30亿碱基对,换算成容量大小则约为
3GB
。
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全基因组测序