動物的話，河蚌最佳。河蚌以水中漂浮的有機質為主要食物，食量大而凈化能力強，且河蚌會翻砂，可以幫著清理底砂累積的腐殖質。
缺點：這貨的幼崽是寄生在魚兒體表的，名叫鉤介幼蟲，雖然通常不那麽致命，但對體弱魚兒就很不友好（若以自然之道的優勝劣汰角度看，其實是有益的）。此外，魚缸裏如果沒有足夠豐富的漂浮有機質或水流性不好，河蚌這等饕餮極易餓死，所以魚缸水可不能太過清澈。
植物的話，青苔或水葫蘆最佳。這兩個的凈水覆蓋面廣且效率高，生長速度較快，對水質適應力強，打理省事。
缺點：需要足夠多的中強光照，水中肥濃度不能太低，平衡沒做好就要爆藻。青苔對於很多人而言不夠美觀，水葫蘆會遮擋水下光照和水面溶氧。
其實，凈水依賴硝化菌為主體的魚缸硝化系統，是魚缸養殖過度追求觀賞性的產物，是現代的一種市場洗腦後的風潮，和傳統的生態養魚在思路上差異很大。生態養魚追求人的觀賞樂趣和自然平衡融於一體，以古法缸為典型。而依賴裝置的魚缸養殖更多的是「人定勝天」的思維，尤以造景草缸為典型，水草燈和二氧化碳裝置的使用，就是強行激發只適應短暫沈水生存的水生植物、可以常年的完、全沈水的旺盛生長。
